事業の検討は、「百年小麦ブランド化委員会」の立ち上げにより各主体が意見を出し合う協議体で運営。「百年小麦ブランド化委員会」には３つの部会が存在し、各分野のメニュー開発、展開施策を検討するとともに、「百年小麦ブランド化委員会」全体では大局的な方向性を検討するスキームとなっている。